怎么算這個金額呢，比如我要開1萬元的發(fā)票，差額是怎么算呢

這個就是你發(fā)下去的工資，還有繳納的社保公積金。

老師，比如和甲方這個月的結算金額是1萬元（含稅），這個月為甲方支付的人工工資3000，社保500，那么開票就是（1萬-3500）/1.06*0.05=307，這個307就是要交的增值稅是么？這個發(fā)票是可以開專票么還是普票？

是的 專票普票都可以呀

老師，我們給甲方開的差額稅票，工資也是甲方直接發(fā)給員工的，比如我票開的10萬，工資甲方發(fā)了5萬，甲方只轉款5萬，我怎么做帳呢，開差額票是不是，發(fā)票金額10萬，差額備注5萬，稅（10萬-5萬）/1.05*0.05