2X17年1月5日，甲公司與業(yè)主就A市軌道交通3號線土建工程簽訂施工總承包合同。合同約定的含稅工程造價為550000萬元(增值稅稅率為9%)，工程質(zhì)量標準需符合相關(guān)施工質(zhì)量驗收規(guī)范及檢驗標準，如獲得魯班獎，則額外獎勵110萬元（含稅）；工期為36個月，經(jīng)甲公司測算，預(yù)計工程總成本為450000萬元（不含稅）。該合同僅包含一項履約義務(wù)，即修建地鐵，且該履約義務(wù)屬于在某一時段內(nèi)履行的履約義務(wù)。甲公司按照實際發(fā)生的合同成本占預(yù)計總成本的比例確定履約進度。該合同約定的主要條款如下：施工期內(nèi)，人工、材料、機器使用費因價格波動影響工程造價時，按照當?shù)毓こ淘靸r管理機構(gòu)發(fā)布的相關(guān)信息對合同價格進行調(diào)整，價格調(diào)整于竣工結(jié)算時執(zhí)行；每季度執(zhí)行一次工程結(jié)算，并于完工時進行竣工結(jié)算；每次驗工計價扣除3%的質(zhì)量保證金，每期驗工計價后5個工作日內(nèi)支付工程款（除質(zhì)保金外）；質(zhì)保期為兩年，質(zhì)保期結(jié)束后無質(zhì)量問題退還暫扣的質(zhì)保金，于10個工作日內(nèi)支付；甲公司在工程結(jié)算當天開具增值稅專用發(fā)票，發(fā)票金額扣除質(zhì)保金；質(zhì)保金在收取款項當天開具增值稅專用發(fā)票；假定甲公司在開出發(fā)票時即發(fā)生增值稅納稅義務(wù)。甲公司為組織施工成立一個項